刘邦攻破沛.县县城
召集沛城父老共商大计。大家都推举刘邦为县令，背秦自立。刘邦却推辞道：“现今天下纷扰，诸侯并起，沛令一席自应选择全县最有声望之人。我并非自爱，实因德薄能鲜，误己事小，倘若误了全城父老，那就百死莫赎，还是快快另选贤能，以图大事吧。”众人见刘邦出言谦逊，更加悦服。于是众人坚请刘邦担任沛令。刘邦仍是再三推让不就，萧何苦劝也无济无事。众人无奈，便选出9位全县最有声望的人，连同刘邦共计10人，把10个人的姓名写在纸上，谨告天地，拈出何人，何人即为沛.县县令，不得推辞。萧何见状，忽生一计，忙对大家说：“诸位这个办法很好，取决于天最公道。这点微劳，须让不才来尽。”众人听了十分赞同，都说：“萧功曹在县办事多年，做事精细，这件事情理当请萧先生处理”一切准备就诸后，萧何又转身对众人说：“刘邦最为乡亲信仰，拈阄之事，我看就请他来担任，以昭郑重。”众人齐声叫好。刘邦只得对天行礼之后，拈出一阄，当众展开一看，上面恰好写着自己的名字，看一眼萧何，又要推辞。萧何见状，忙走上前去，一把将盘中剩余的纸阄抓起，放入口中嚼碎，然后高声说道；“天意所归，还有何说。”众人听了，欢声雷动。刘邦无奈，只好应诺。于是，他们便在县衙大堂举行了仪式，誓师起事，并按楚国旧制，称刘邦为“沛公”。事后，刘邦才知道原来萧何所写的10个纸阄全是刘邦的名字，深知萧何真心拥戴自己，内心十分感激。从此，萧何紧随刘邦南征北战立下了盖世的功勋。
深谋远虑收存典籍
秦二世二年（公元前208年）九月，项梁叔侄杀了会稽郡守殷通，举起义旗。不久，便召集了20余万兵马，拥立楚王第12皇孙13岁的熊心为王，并与刘邦所部会于薛城。众将约定：项羽北向救赵，解巨鹿之围后，从北路向西攻秦，刘邦从南路西进向关中进发。两路人马在击败秦军后，谁先入秦都咸阳，谁当关中王。
刘邦率军勇往直前，凭靠张良等人的谋划，避实就虚，剿抚并用，一路夺关斩将，直抵关中。萧何身为丞督，坐镇地方，督办军队的后勤供应。公元前206年十月，刘邦率大军兵临咸阳城。秦王子婴设计杀了奸相赵高，献出玉玺，向刘邦投降。于是，起义大军浩浩荡荡开进咸阳城。将士们见秦都宫殿巍峨，街市繁华，顿时忘乎所以，纷纷乘乱抢掠金银财物，连沛公也忍不住，趁着空闲，跑到秦宫去东张西望。他看见华丽的宫室，古怪的摆设，成堆的金银珠宝，猎狗骏马，珍奇玩物，还有一群群的美女，不觉眼花缭乱，飘飘然起来，甚至贪恋秦宫的富贵而不忍离开。他神魂颠倒地拥着美女走进胡亥的寝宫，往龙床上一躺，便进入了温柔乡。突然，大将樊哙破门而入，大声说道：“沛公想取天下，还是想当富家翁？这些奢华之物，正是秦亡的祸根。切勿迷恋于此！”
与此同时，张良等人也来陈述利害，刘邦这才幡然自悟当下命兵士查封皇宫府库，然后率众将士返回灞上。惟独萧何，进入咸阳后，一不贪恋金银财物，二不迷恋美女，却急如星火地赶往秦丞相御史府，并派士兵迅速包围丞相御史府不准任何人出入。然后让忠实可靠的人将秦朝有关国家户籍、地形、法令等图书档案一一进行清查，分门别类，登记造册，统统收藏起来，留待日后查用。因为，依据秦朝的典制，丞相辅佐天子，处理国家大事；御史大夫对外监督各郡御史，对内接受公卿奏事。除了军权外，丞相和御史大夫几乎总揽一切朝政。萧何做官多年，当然知道这些。对此，全军上下无不佩服，刘邦在惭愧之余，说：“萧何确是异才，不枉我提拔他一场。”萧何收藏的这些秦朝的律令图书档案，使刘邦对天下的关塞险要、户口多寡、强弱形势、风俗民情等等了如指掌，为制定正确的方针政策和律令制度找到了可靠的根据，对日后西汉政权的建立和巩固，起到了巨大的作用，功不可没。这也足见萧何的深谋远虑。
慧眼识才力荐韩信
刘邦率先攻入咸阳后不久，项羽也率军入关，并在同年二月自封为西楚霸王，占有梁楚东部9郡之地，建都彭城（今江苏徐州）。并背弃原来的约定，改立刘邦为汉王，辖治荒远偏僻的巴、蜀、汉中之地，建都南郑。为了阻止刘邦东进，项羽又把关中地区一分为三，分封给了3个秦朝降将——雍王章邯、翟王董翳、塞王司马欣。刘邦看出了项羽的险恶用心，憋了一肚子气，有心与项羽决一死战，怎奈势单力薄，实难取胜。只好采纳萧何、张良等人的建议，隐忍入蜀，休兵养士，广招人才，待机再与项羽争个高低。
四月，各路诸侯各自领兵回到自己的封地。刘邦按张良的计谋，偃旗息鼓，人不解甲，马不停蹄，急匆匆地向巴蜀进发。一路上，许多来自其他诸侯王军中的兵士自愿投到刘邦的旗下，韩信就是在这个时候从楚营中逃出，投奔刘邦。韩信原是项羽的部下，他有勇有谋，是天下无双的军事家。但在项羽手下却得不到重用，于是就投到刘邦麾下。起初，刘邦让他当了一个管理粮草的小官，韩信大失所望。一次偶然的机会，萧何结识了韩信。在接触过程中，萧丞相发现韩信有胆有识，是个不可多得的人才，于是多次向刘邦推荐，但并没有引起刘邦的重视。
转眼间两个多月过去了。汉军将士不愿在蜀中久驻，整天思念家乡，念叨东归，开小差的人也越来越多。一天，韩信见久在汉营仍不受重用，一气之下离开了汉营。萧何得知后，马上放下尚没处理完的紧急公务，亲自策马追赶韩信，连个招呼也来不及向刘邦打。刘邦正为军中开小差的人日益增多而焦急，忽然有军吏来报告说：“萧丞相也跑了。”刘邦一听大惊失色，说：“这还了得!我正要与他商议军中大事，怎么他也逃走了！”当下派人去找萧何。一连两天也不见萧何的影子，急得刘邦坐立不安。再说萧何为追韩信，不辞辛苦，一路问，一路追，直到天黑了，还没追着韩信。正想下马休息一下，忽然远远望见有个人牵着马在河边徘徊。萧何顿时抖擞精神，快马加鞭，大声喊着：“韩将军!韩将军！”他策马赶到河边，气喘吁吁地下了马，气呼呼地说：“韩将军，咱们总算一见如故，够得上是朋友。你怎么不说一声，就这么走了？”韩信仍不吭声。萧何又说了一大堆劝他回去的话。这时候，滕公夏侯婴也策马赶到；两个人苦苦地相求非要韩信回去不可。他们说：“要是大王再不听我们的劝告，那我们三个人一起走，好不好？”韩信只好跟着他们回去。到了第三天，三人才回到南郑。
萧何去见刘邦，刘邦见到萧何又惊又怒，说道：“你为什么也想逃跑？”萧何说：“我不敢逃跑，我是去追逃跑的人去了。”刘邦问他：“你追的是谁？”萧何答道：“韩信。”刘邦听后，很不以为然地说：“逃走的将军有十多个了，也没听说你去追过谁，怎么偏要去追韩信？这明明是在骗我！”萧何说：“那些将军都容易得到，可韩信却是当今数一数二的杰出人才，跑了就再也没有第二个了。大王如果只想当个汉中王，没有韩信也就算了；如果要准备打天下，那就非用韩信不可。您到底准备怎么样？”刘邦说：“我当然想打出去，怎么能老困闷在这里呢？”萧何说：“大王若决定出汉中，能重用韩信，他自然会留下；如果不重用他，他终究会离开的。”“那么，”刘邦下决心说：“就依着丞相，让他做个将军，怎么样？”萧何说：“叫他做将军，他还得走。”“那拜他为大将军怎么样？”萧何说：“很好。”刘邦当时就让萧何去召韩信来，马上就拜他为大将军。萧何直率地说：“大王平时太不注重礼仪了。拜大将军是件大事，不是小孩子闹着玩儿似的叫他来就来。大王真要拜韩信为大将军，先得命人造起一座拜将台，选个好日子，大王还得沐浴更衣，亲自戒斋，然后隆重地举行拜将仪式。这样，才能让全体将士都能听从大将军的指挥，就像听从大王的指挥一样。”刘邦说：“好吧，我都听你的，请你去办吧。”这就是“萧何月下追韩信”这一历史故事的由来。几天以后，萧何命人已筑好了拜将坛。汉王刘邦择了吉日，带领文武百官，来至坛前，缓步拾级而上。只见坛前悬着大旗，迎风招展，四面列着戈矛，肃静无哗。一轮红日光照将坛，真是旌旗耀武，甲杖生威。丞相萧何已将符印斧钺，呈与汉王刘邦。坛下一班金盔铁甲的将官，都翘首伫望，不知这颗斗大的金印，究竟属于何人。只见萧何代宣王命，高声喊道：“谨请大将军登坛行礼!”当下陡然闪出一人，从容步上将坛。大家定睛一看，原来是韩信，顿时一片哗然。这也难怪，一个军中不出名的小吏，如今一下子拜为大将军，怎不令众人议论纷纷。众人见汉王刘邦；丞相萧何却是那么毕恭毕敬，越发感到莫名其妙。后来，韩信果然没有令刘邦失望，没有辜负萧何的良苦用心。在楚汉战争中，韩信率汉军渡陈仓，战荥阳，破魏平赵，收燕伐齐，连战连胜，在垓下设十面埋伏，一举将项羽全军歼灭，为刘邦平定了天下。很显然，在楚汉战争中，韩信军事才能的充分发挥和运用，乃至汉王刘邦能够最终夺取天下，从一定程度上说，同萧何的慧眼识才，倾力荐贤是密不可分的。
坐镇关中保障军饷
汉元年（公元前206年）八月，刘邦率军悄悄离开南郑，采纳了张良、韩信所献的“明修栈道，暗渡陈仓”之计，挥师东进，留下萧何负责征收巴蜀之税，供给军粮。汉军将士人蜀后，思念家乡，东归之心甚切，一旦东归，个个如猛虎下山，奋勇争先，直杀得雍王章邯的兵马丢盔卸甲，落荒而逃。汉军一路势如破竹，不到一个月便占据了三秦之地。刘邦令萧何坐镇关中，安抚百姓，同时负责兵员和粮饷的筹措与补给，自己则率大队人马浩浩荡荡地向彭城进发。
由于几经战事，这时的关中已是满目疮痍，残破不堪，秦都咸阳被项羽放火烧了3个月，已成一片瓦砾。萧何留守关中后，马上安抚百姓，恢复生产，全力收拾关中的残破局面。他一方面重新建立已经散乱的统治秩序，另一方面对百姓施以恩惠，以定民心。他不仅颁布实施新法，重新建立汉的统治秩序和统治机构，修建宫廷、县城等等。另外又开放了原来秦朝的皇家苑囿园地，让百姓耕种，赐给百姓爵位，减免租税等等。他还让百姓自行推举年龄在50岁以上、有德行、能做表率的人，任命他们为“三老”，每乡一人；再选各乡里的三老为县三老，辅佐县令，教化民众，同时免去他们的徭役，并在每年的年末赐给他们酒肉。这样，由于萧何办事精明，施政有方，颁布利民法令，农业生产迅速得到恢复，建立了稳固的后方，保障了前线的需要。
汉二年，刘邦乘项羽大军东征之机，乘虚而入，攻占了项羽的老巢彭城（今江苏徐州）。汉军进驻彭城后，被胜利冲昏了头脑，麻痹大意，放松的警惕，不久便被项羽率3万精兵绕道杀回，将刘邦团团围困于彭城灵壁（今安徽濉溪市南）。幸亏陈平献“金蝉脱壳”之计，才得以带着数十骑残兵败将逃回荥阳。这时，关中的壮丁多数已被征发，萧何便调拨老弱及不到服役年龄的少年到荥阳增援，韩信也收兵与刘邦会师，刘邦这才得以重振旗鼓，与项羽大军相持于荥阳、成皋一带。当时，萧何坐镇关中，征发兵卒，运送粮草，供应汉军；侍奉太子，制定法令规章，建立宗庙秩序。有关事项每次报呈刘邦，刘邦总是同意，允许照办。即使来不及报告，萧何也可以根据具体情况先行执行，等汉王回来再作报告。刘邦几次战役，弃军逃跑，当时萧何若稍有二心，便可置刘邦于死地。可萧何每次都征发关中兵，补足汉军缺额，刘邦也因此得以重新振作，多次转危为安。公元前203年，项羽也由于连年战争，陷入了兵尽粮绝的困境。而刘邦的部队，却由于萧何坐镇关中，不断地向前方输送粮食和兵力，形成了兵强粮多的好形势。后来，刘邦越战越强，终于逼得项羽兵败垓下，自刎乌江。
刘邦论功行赏分封
行赏分封诸侯后，定都的问题又迫在眉睫。起初，打算定都洛阳，后来戍卒娄敬面见刘邦，建议依借关中的险要形势，定都咸阳（今陕西长安县西北）。刘邦征求张良的意见后，当即决定定都咸阳。并封娄敬为奉春君，赐姓刘。于是，刘邦暂居栎阳，命丞相萧何营建咸阳。公元前199年，皇宫竣工，萧何奏请御驾往视。刘邦于是从栎阳到咸阳，萧何接驾，导入游观。最大的一座，叫做未央宫，周围的有二三十里。东西两方，阙门最广。殿宇规模，亦皆高敞，尤以前殿最为豪华壮丽。武库、太仓，分建殿旁，气象巍峨。刘邦巡视一番后，嫌宫室过于壮丽豪华，责备萧何道：“朕之起义，原为救民。现今天下初定，民穷财尽，怎将这座宫殿造得如此奢华？”萧何见汉帝责怪，不慌不忙地说：“正因为天下刚刚安定，才好借机会多征发些人和物来营建宫室，况且天子以四海为家，宫室壮丽才能显出威严，也免得子孙后代再来重建。”刘邦见萧何回答的如此得体，便转怒为喜道：“如此说来，朕未免错怪你了。”萧何听汉帝在安慰自己，接着说：“微臣此事虽蒙陛下宽宥，但来日方长，难免有误，尚望陛下有以教之。”汉帝微笑着说：“你做事颇有远见，朕记得当年攻破此地时，诸将乘乱人宫，未免有所携取，惟汝只取书籍表册而去，目下办事有条不紊，方便多了。”萧何亦笑道：“臣无所长，一生为吏，对于前朝典籍，视为至宝，平日得以借鉴。今为陛下一语道破。陛下天资聪慧，事事留意，真非臣下可及万一也。”汉帝听了大喜，便指着未央宫的四周，对萧何道：“此处可以添筑城垣，作为京邑，就叫长安吧。”从此，咸阳便更名为长安了。至此，西汉建都长安，历时200余年，萧何成为该城的最早规划和设计者。
成也萧何败也萧何
成也萧何，败也萧何，比喻事情的成败都出于同一个人。这原是一条民间俚语，见于宋洪迈《容斋续笔·萧何绐韩信》：“韩信为人告反，吕后欲召，恐其不就，乃与萧相国谋，诈令人称陈已破，绐信曰：‘虽病强入贺。’信入，即被诛。信之为大将军，实萧何所荐，今其死也，又出其谋，故俚语有‘成也萧何，败也萧何’之语。”
韩信年轻时带剑投奔项梁，默默无闻；后隶属项羽，也只做个郎中，他多次献策以求重用，项羽都未采纳。刘邦入蜀时，韩信弃楚而投汉，依然默默无闻。只任迎宾小吏，却因犯法被处斩刑，刀口下出狂言，惊动滕公夏侯婴，荐为治粟都尉；是萧何发现了韩信这奇才，但仍未获重用。军至南郑，韩信自觉出头无日，便随众将逃亡。萧何未及请示，便月下追韩信。有人向刘邦报告丞相也逃亡了，刘邦惊怒。过了两天，萧何回来，刘邦且喜且怒，怒曰：“你为何也逃跑？”萧何曰：“我不敢逃跑，是去追逃跑的人。”刘邦得知他去追韩信，曰：“将领们跑了数十人，你不去追，却偏偏只追韩信一个，难道不是假的嘛！”萧何曰：“诸将易得耳。至如信者，国士无双。大王若只想称王汉中，就用不着韩信；若要争夺天下，除了韩信，没有第二个人可同您共谋大事的了！”于是劝刘邦选择吉日良辰，斋戒设坛，隆重拜韩信为大将。一夜之间，韩信从一无名小卒继位上将军。一统三军，这就是成也萧何。后来，韩信运筹帷幄，逐鹿中原，为刘汉王朝打下半壁江山，封王列侯。有人告他谋反。刘邦削了他的兵权。汉十年，刘邦亲征陈豨。韩信称病未出，却暗中派人与陈联络，家臣告密，坐镇京城的吕后想召见韩信，又怕他拥兵不肯就范，就同萧何商议计策。解铃还须系铃人，毕竟萧何老谋深算，他派人传旨韩信，声称陈豨已经被捉拿斩杀了，列侯、群臣都要进宫朝贺。萧何欺骗韩信道：“你尽管有病在身，也得勉强进宫朝贺，以免皇上生疑。”
可怜韩信聪明一世，糊涂一时。一踏进宫门，即被吕后预伏的刀斧手劫持捆绑，架至长乐宫悬钟室，身首异处了。这是第二次临刑了，他喟叹道：“我后悔没有采纳蒯通的计谋，竟被妇人小子所欺骗，这难道不是天意吗？”于是诛杀了韩信一家三族。这就是败也萧何。
公元前202年二月，刘邦做了皇帝以后，为了巩固新兴的西汉政权，便开始了逐一地翦灭异姓王的斗争。他见韩信功高望重，且握有兵权，便首先从他身上下手。其实，早在韩信为大将军后，刘邦便对韩信有所疑忌。他一方面巧妙地利用韩信攻城略地，为汉王朝的开创立下了赫赫战功；另一方面，待自己羽翼丰满、实力雄厚之后，便开始一步步地排挤、贬低韩信。在楚汉战争中，当韩信在北线破魏平赵，收燕伐齐后，便虚抚韩信，封他为齐王；待汉军兵围楚军于垓下、最后消灭项羽后，刘邦旋即改封韩信为楚王，使其远离根基深厚的齐地；其后又借巡游云梦泽之机，设计擒住韩信，并以谋杀罪将其押回京都，软禁起来，同时削去了韩信的兵权，最后将其降为只有虚名的淮阴侯’公元前197年，阳夏侯陈稀举兵谋反，自立为王。刘邦亲率大军前去征讨。当时韩信推说自己有病，没有随同前往。谁知，韩信手下的人上书告发，说陈稀造反是韩信的主意，韩信与陈稀秘密约定，里应外合，由韩信做内应，准备在一天夜里，假传圣旨，释放囚在牢里的所有奴隶和犯人，干掉吕后和皇太子刘盈，然后共取天下。吕后一听事关重大，便急忙秘密召见丞相萧何，商量对策。二人商定对策后，由萧何去执行。
萧何回到家中，心中百感交集，依计派出一名心腹，打扮成军人模样，偷偷绕到北边转了一圈，回来故意称是皇上派来报信的，说陈稀已全军覆没，皇上就要凯旋回朝。众臣听到捷报，都来宫中贺喜，只有韩信称病不出。第二天，萧何就派人请韩信到相府赴宴，谁知韩信自称有病，婉言谢绝了。于是，萧何便亲自来到韩信府上，以探病为由，直接进入韩信的内室。韩信见萧何已经来了，再也无法推托，只得与萧何寒暄一番。萧何说：“我和你向来是好朋友，请你去赴宴，是有话对你说。”韩信忙问有什么话。萧何说：“这几天皇上从赵地发来捷报，说征讨大军大获全胜，陈稀已经逃至匈奴。你称有病不上朝，已经引起人们的怀疑了。现在皇上打了胜仗，大家都去朝贺，你不去，这样恐怕不好吧。”萧何说的很有道理，韩信才勉为其难。何况萧何是他原保之人，更是深信不疑，便跟着萧何来到长乐殿向吕后道贺。岂不知宫里早已埋伏着刀斧手，吕后一见韩信中计。喝令刀斧手将韩信绑翻在地。韩信见事不妙，急忙呼叫：“萧丞相快来救我!”哪知萧何早已避开，哪里还呼喊得应？吕后坐在长乐殿上，尽数了韩信如何与陈稀暗约谋反，如何欲害她和太子等罪，也不容韩信申辩，便令刀斧手把他拖到殿旁钟室中杀死。随后，吕后又下令将韩信的父、母、妻三族一股脑捕杀净尽。
萧何辅助吕后，诛杀韩信，很符合汉帝“固根基”的方略，是为刘邦除去了一块心病。刘邦对萧何更加恩宠，加封五千户。这就是后来人们常说的“成也萧何，败也萧何”一语的由来。
自污名节以释君疑
萧何计诛韩信后，刘邦对他更加恩宠，除对萧何加封外，还派了一名都尉率500名兵士作相国的护卫，真是封邑进爵，圣眷日隆。众宾客纷纷道贺，喜气盈庭。萧何也非常高兴。这天，萧何在府中摆酒席庆贺，喜气洋洋。突然有一个名叫召平的门客，却身着素衣白履，昂然进来吊丧。萧何见状大怒道：“你喝醉了吗？”
这位名叫召平的人，原是秦朝的东陵侯。秦亡后隐居郭外家中种瓜，味极甘美，时人故号东陵瓜。萧何入关，闻知贤名，招至幕下，每有行事，便找他计议，获益匪浅。今天，他见萧何仍未领会他的意思，便说：“公勿喜乐，从此后患无穷矣！”萧何不解，问道：“我进位丞相，宠眷逾分，且我遇事小心谨慎，未敢稍有疏虞，君何出此言？”召平说道：“主上南征北伐，亲冒矢石。而公安居都中，不与战阵，反得加封食邑，我揣度主上之意，恐在疑公。公不见淮阴侯韩信的下场吗？”萧何一听，恍然大悟，猛然惊出一身冷汗。第二天早晨，萧何便急匆匆入朝面圣，力辞封邑，并拿出许多家财，拨入国库，移作军需。汉帝刘邦十分高兴，奖励有加。
刘邦亲自率兵征讨。他身在前方，每次萧何派人输送军粮到前方时，刘邦都要问：“萧相国在长安做什么？”使者回答，萧相国爱民如子，除办军需以外，无非是做些安抚、体恤百姓的事。刘邦听后，总是默不作声。来使回报萧何，萧何亦未识汉帝何意。一日，萧何偶尔问及门客，一门客说：“公不久要满门抄斩了。”萧何大骇，忙问其故。那门客接着说：“公位到百官之首，还有什么职位可以再封给你呢？况且您一入关就深得百姓的爱戴，到现在已经十多年了，百姓都拥护您，您还再想尽方法为民办事，以此安抚百姓。现在皇上所以几次问您的起居动向，就是害怕您借助关中的民望有什么不轨行动啊!试想，一旦您乘虚号召，闭关自守，岂非将皇上置于进不能战，退无可归的境地？如今您何不贱价强买民间田宅，故意让百姓骂您、怨恨您，制造些坏名声，这样皇上一看您也不得民心了，才会对您放心。”萧何长叹一声，说：“我怎么能去剥削百姓，做贪官污吏呢！”门客说：“您真是对别人明白，对自己糊涂啊!”
萧何何尝不明白，对于一般的小官吏，汉帝并不怕他们有野心。所以一有贪赃枉法行为，必遭严惩。对于自己这样的大臣，汉帝主要是防止他们有野心，对于贪赃枉法那些小事，反不足轻重了。为了释去主上的疑忌，保全自己，萧何不得已违心地做些侵夺民间财物的坏事来自污名节。不久，萧何的所作所为就被人密报给了刘邦。果然，刘邦听后，像没有发生什么事一样，并不查问。当刘邦从前线凯旋归来时，百姓拦路上书，控告萧相国强夺、贱买民间田宅，价值数千万。
刘邦回到长安后，萧何去见他时，刘邦笑着把百姓的上书交给萧何，意味深长地说：“你身为相国，竟然也和百姓争利！你就是这样“利民”啊？你自己向百姓谢罪去吧!”刘邦表面上让萧何向百姓认错，补偿田价，可内心里却暗自高兴，对萧何的怀疑也逐渐消失。镇国家、抚百姓的萧何，违心地干了侵害百姓利益的事情，心中很不安，总想找机会补偿百姓。不久，萧何看到长安一带耕地狭小，百姓缺衣少食，可是天子的上林苑中却有许多闲着的荒地用来放养禽兽。萧何觉得太浪费了，便上奏请皇上把这些荒地分给百姓去耕种，收了庄稼留下禾杆照样可以供养禽兽。汉帝刘邦当时正在病中，见此奏章，又恨萧何取悦于民，一怒之下，下令将萧何逮捕入狱。满朝文武以为萧何必犯了大逆不道之罪，怕连累自己，都不敢替他申辩。幸亏有一个名叫王卫尉的人，平日素敬萧何的为人，在侍卫刘邦时顺便向刘邦探问：“萧相国犯了什么大罪？”刘邦余怒未消，道：“休要提他？提起他朕就生气。当年李斯为秦相时，做了好事都归君主，出了差错就揽在自己身上。现在萧何受了商人的许多贿赂，竟要求我开放上林苑给百姓耕种，这分明是想取悦于民，自己得个好名声吗？不知道把我看成是什么样的君主了！”王卫尉闻言奏道：“陛下未免错疑丞相了。臣闻百姓足，君孰与不足，相国为民兴利，化无益为有益，正是丞相调和鼎鼐应做的职务。民间百姓感激，断不会感激丞相一人，因为有这样的良相，必是贤明之君主选用的。还有一层，丞相如有野心，当年陛下在外征战数年，他那时候不费吹灰之力便可坐据关中，何至反以区区御苑，示好百姓，而去收买人心呢？”王卫尉见汉帝认真在听，顿了一下，继续说道：“前秦灭亡，正因君臣猜忌，才给了陛下机会。陛下若疑忌萧丞相，不但浅视了萧何，也看轻了陛下自己呀。”刘邦听了，心里虽然不大高兴，但想想王卫尉的话毕竟有些道理，于是挥挥手，当天就命人放了萧何。
开恩释放谨慎恭敬
萧何当时已是60多岁的老人了，见刘邦开恩释放了他，更是诚惶诚恐，谨慎恭敬。虽然因为全身带上刑具，害得他手足麻木，连路都快走不动了，而且蓬头赤足，污秽不堪，但又不敢回府沐浴再朝拜天子，只得这样上殿谢恩。刘邦见萧何如此狼狈，也觉得有些过意不去，便安抚萧何道：“相国不必多礼!这次的事，原是相国为民请愿，我不允许。我不过是夏桀、商纣那样的无道天子罢了，而你却是个贤德的丞相。我之所以关押相国，就是要让百姓知道你的贤能和我的过失啊！”刘邦的这段话虽然言不由衷，但对萧何的廉政为民，终于还是默认了。从此以后，萧何对刘邦更是诚惶诚恐，恭谨有加了。刘邦也照例以礼相待，但萧何从此对国事就只能保持沉默了。
鞠躬尽瘁死而后已
汉十二年（公元前195年）四月二十五日，汉高祖刘邦病逝于长乐宫，享年62岁。同年，太子刘盈即位，是为惠帝。萧何继任丞相。不过这时，萧何年事已高。这期间，萧何在“约法三章”的基础上，参照秦法，摘取其中合乎当时社会情况的内容，制定了律法共九章。这是汉朝制作律令的开端。萧何制定的汉律九章，删除了秦法的苛繁、严酷，使法令更为明简。公元前193年，年迈的相国萧何，由于常年为汉室操劳，终于卧病不起。病危之际，汉惠帝亲自前往探望，并趁机询问：“丞相百年之后，谁可代之？”接着惠帝又问：“曹参如何？”萧何听了，竟挣扎起病体，向惠帝叩头，道：“陛下能得到曹参为相，我萧何即使死了，也没有什么遗恨了!”谥文终侯。娶妻同氏，封一品夫人，生子二，长子萧禄，次子萧延。
萧何死后，曹参继任丞相，一切公务悉照旧章，照例而行，清静治民，乐在其中。长此以往，一些朝臣便在惠帝面前参奏他********，惠帝也疑心他倚老卖老，便召见曹参问其缘故。曹参反问惠帝道：“陛下自思圣叨英武，能及先帝吗？”惠帝被问得涨红了脸，答道：“朕年未成冠，且无阅历，如何及得先帝！”曹参又问：“陛下视臣及得萧丞相吗？”“朕看来似乎也不能及。”惠帝答道。“陛下说的正是!伏思先帝以布衣起家，南征北讨，方有天下。若非大智慧，大勇毅，焉能至此。萧丞相明订法令，中具规模，行之已久，万民称颂。今陛下用臣为相，只要能够奉公守法，遵照旧章，能继旧业，已属幸事。若自作聪明；推翻成法，必致上下紊乱，恐欲再求今日之太平，已无可得矣！”惠帝恍然大悟。这就是成语“萧规曹随”的来历。就这样，曹参位相3年，极力主张清静无为不扰民，遵照．萧何制定好的法规治理国家，使西汉政治稳定、经济发展，人民生活日渐提高。
汉王五年，已经杀死了项羽，平定了天下，论功行赏，群臣争功，过了一年多也评定不下来。高祖因为萧何功劳最大，把他封为酇侯，得到的领地最多。功臣们都说：“我们亲自身披铠甲，手执兵器，多的打过一百多次仗，少的也经历了几十次战斗，攻城野战，夺取地盘，功劳有大有小。现在萧何没有汗马之劳，只是靠文字写作，提点建议，不参加作战，反而比我们得的封地多，这是为什么？”高祖说：“各位知道打猎吗？”大家说：“知道。”高祖说：“知道猎狗的作用吗？”大家说：“知道。”高祖说：“打猎的时候，追赶捕杀野兽兔子靠的是狗，但发现野兽踪迹，向狗指示野兽所在之处的却是人。现在你们各位只能捉到奔跑着的野兽，功劳的性质和猎狗相当，至于萧何，他能发现踪迹，指示方向，功劳的性质和猎人相当。况且你们只是自己跟随着我，多的一家有两三个人。现在萧何全家族几十个人都跟着我，他的功绩是不能忘掉的。”大家都没有人敢说话了。
列侯们全都接受了封赏，在排列他们地位的先后时，大家都说：“平阳侯曹参身上负过七十处伤，攻城野战，夺取地盘，功劳最多，应当排第一。”高祖已经对功臣们力排众议，多封给了萧何领地，到排列地位先后时，没有理由再驳倒他们，但心里还是想排萧何为第一。关内侯鄂千秋上前说：“大家的意见都不对。曹参虽然有攻城野战夺取地盘的功劳，这只是暂时得利的事情。皇上和楚国对抗五年，经常损失军队，几次只身逃走，但萧何经常从关中派军队前往皇上所在的地方补充，没有皇上的命令征调，却多次有几万军队在皇上兵力匮乏时到来。楚、汉双方在荥阳对峙了好几年，军队没有现成的粮食，萧何在关中通过水路和陆路运送，供给粮食，不使前线缺粮。皇上虽然多次失去了崤山以东地区，萧何经常保全关中等候着皇上，这是千秋万代的功业。现在即使少了曹参这样的人几百个，对汉朝来讲有什么损失？汉朝有了他们，也不一定就非靠他们才能成功。怎么能让一时的功绩凌驾于千秋万代的功绩之上呢？萧何应当排第一，曹参排第二。”高祖说：“对。”于是便让萧何排第一，容许他带着剑穿着鞋上殿，拜见皇帝时可以不快步行走。
高祖说：“我听说推举贤人应该受重赏。萧何功劳虽然高，由于有了鄂君的评说，大家才更加认识清楚。”于是就在鄂千秋原来享有的关内侯封地的基础上封他为安平侯。这天，高祖对萧何的父子兄弟十几个人都予以封赏，每人都有封地。又给萧何加封了两千户领地，因为高祖以前到咸阳服徭役时，只有萧何送自己的礼钱比别人多了两枚。
汉高祖十一年，陈豨造反，高祖亲自率兵到邯郸镇压，叛乱还没有平息，淮阴侯韩信在关中谋反，吕后采纳了萧何的计谋，诛杀了韩信，详细情况记载在《淮阴侯列传》中。高祖听到韩信被诛杀的消息后，派使者任命丞相萧何为相国，加封给他五千户领地，命令一名都尉率领五百士兵作为相国的卫队。人们都向萧何庆贺，只有召平来向他表示哀吊。召平是原来秦国的东陵侯，秦朝灭亡后，他成为平民，家里贫穷，在长安城东种瓜，他的瓜很甜美，所以民间称为“东陵瓜”，是根据召平而得名的。召平对萧何说：“灾祸从此要降临了。皇上在外风餐露露宿，你在朝廷留守，没有冒着矢石去作战，却加封给你领地，又为你设立卫队，这是因为淮阴侯刚在京城谋反，皇上对你也不放心了。他设立卫队保护你，并不是要用这种方式来给你增加荣耀。希望你让出封地不要接受，把全部私有财产都拿出来赞助军费，皇上心里就高兴了。”萧何听从了他的建议，高祖这才非常高兴了。
高祖十二年秋天，黥布造反，高祖亲自率兵去镇压，多次派使者回来问相国在做些什么。萧何因为高祖在军队中，便像平息陈豨叛乱时一样，安抚勉励百姓，拿出所有的财物供应军需。有个客人对他说：“你被灭族的时间不会很长了。你的地位是相国，功劳第一，还能再给你加官晋级吗？而你从刚入关中起就得到百姓的拥护，十多年了，百姓都归附你，你却还在努力地得百姓的好感。皇上多次派人来问你的情况，是怕你颠覆关中。你现在为什么不多买田地，用低的价钱强行向人赊借，用这些方法毁坏自己的名誉，皇上才能对你放心。”萧何便听从了他的主意，高祖这才十分高兴起来。
高祖结束了讨伐黥布的战事回来，百姓们拦路上书告状，说相国用低价强行购买百姓的土地房屋，价值几千万钱。高祖到达长安，萧何前去拜见，高祖笑着说：“堂堂的相国居然向百姓渔利。”他把百姓的揭发信全都给了萧何，对他说：“你自己去向百姓认错吧。”萧何便为百姓请求说：“长安地方狭小，上林苑中有很多空地，希望能允许百姓进去耕种，不要让他们收走秸杆，留下来作为禽兽的饲料。”高祖非常生气地说：“相国接受了商人的很多财物，倒来为他们向我要上林苑！”便把萧何交给廷尉关押起来，给他戴上了镣铐。过了几天，有个姓王的卫尉陪着高祖，他上前问高祖说：“萧相国犯了什么大罪？皇上怎么突然把他关起来了？”高祖说：“我听说李斯辅佐秦始皇时，有好事便归功于皇帝，有过失就自己承担责任。现在相国拿了商贩们的钱，却为百姓向我要上林苑，用这个办法讨好百姓，所以我把他关起来治罪。”王卫尉说：“在职责范围内的事，如果对百姓有利，相国向皇上请求，这真是宰相应该办的事，皇上怎么能怀疑相国是因为接受了商人的钱呢？况且皇上抗击楚国好几年，陈豨和黥布造反，皇上亲自率兵去平息，在当时，萧相国留守关中，只要动一下手脚，函谷关以西就不属于皇上所有了。萧相国不在这时候给自己谋利，现在反而会贪图商人的钱吗？并且秦朝皇帝因为听不到人们议论自己的过失而失去了江山，李斯为皇帝分担过错的责任，又哪值得效法呢？皇上怀疑宰相的见识为什么这样短浅呢？”高祖听了，心中不高兴，这天，他派使者拿着符节放出了萧何。萧况年老，一向恭敬谨慎，光着脚向高祖陪罪。高祖说：“相国不必这样，您为百姓请求上林苑，我不答应，我不过是像桀、纣一样的君主，而相国是贤明的宰相。我故意将您关起来，是为了让百姓知道我的过错。”
萧何一向和曹参不好，在他病重时，孝惠帝亲自去探望他的病情，顺便问他：“您如果百岁以后，谁可以接替您的职位呢？”他回答说：“没有人比君主更了解大臣的。”孝惠帝说：“您看曹参怎么样？”萧何叩着头说：“皇上找到合适的人选了。我死了也不遗憾了。”
萧何购置土地房屋总是选在偏僻的地方，建造住宅不修围墙等，对人说：“后代人如果好，就效法我的简朴，如果不成器，这种房屋也不会被有权势的人家夺去。”孝惠帝二年，相国萧何去世，谥号为文终侯。
萧何有四代后人由于有罪而失去过世袭的爵位，每当断线时，天子总是再寻找萧何的其他后人，再封为酇侯，功臣中没有人能比得上。
太史公说：“萧何相国在秦朝时担任文笔小官，庸庸碌碌，没有突出的作为。在汉朝兴起时，他依傍了天子的光辉。萧何为汉朝谨守关中这一家底，利用百姓痛恨秦朝法令的情况，顺应潮流，和他们一起革新政治。韩信、黥布等人都已经被诛杀，萧何的功勋就显得十分显耀了。他位置处于群臣之首，声望流传后世，他的功业可以和周文王时的闳夭、散宜生等人比高低了。”