当天的晚宴上，刘大同也代表秦铠宣布了另外一个决定，除了新成立的东北集团军外，从前线调回的新一、二、三、六、七、九、十各镇立刻进行整编，城里陆军部委员会统一协调军制整编事宜，各镇必须在两个月内完成新军编组并且足额补充队伍。
这倒命令不过三四十个字，但这绝对是让人震撼的消息……南洋新军从入京作战以来，一年多时间几乎都是整戈待旦，这新军制早就在军政部内部提过多次，却一直因为战事繁忙而无从下手，要知道，无论是扩编还是整编，那都意味着整支部队的指挥体系的崩溃，这对于队伍而言，无疑是致命的！
但是，南洋新军的整编却是如在弦之箭，不得不发……对滨海、阿穆尔行省的攻略中，以镇为指挥机构、以营为集团主杆的战争指挥模式已经曝露出太多的不便，以至于薛超、章奎、刘永福等不得不在战事中抽调精干参谋到前线协调各营机动。
更重要的是，以营为基础的军队，已经曝露出组织起大规模的战役上的指挥弊端，小口径野炮、骑炮、后装步枪、各类机关炮的出现，使得营级单位的战斗力大大增强，这次对双城子、海参威的进攻中，以营为单位的进攻模式，展示了南洋新军的突出战力。
但是，秦铠和参谋部、以及各镇的高层指挥官都意识到一个问题。南洋新军各镇。几乎都是完完全全的超大编制的军团。整个南洋新军无疑都是在战争中成长起来的队伍，所以，一直来，扩大队伍都是这些军官们的一致认识，在过去六年前，基于现有体制下，新军规模从最初的万余护**扩编到现在的十五万之众。
但是，十五万的军队意味着一个吓死人的基层编制数量……超过300个营！秦铠对于自己的军队有着深刻的认识。可以说，现在的南洋新军已经完全不同于旧编制的军队，以章奎的二镇来说，二镇的核心部队都是以参加越北战事成长出来的军队扩编的而来。
在辽阳的两年间，章奎派人前往各地招募劳力，同时在当地展开预备役的训练，北方战役一打响，他的队伍规模甚至超过了经营外东北多年的刘永福部，有近60个营的规模，滨海战役一打响。光是命令传达、军资补给，就发生了不小的麻烦。毕竟这些都是关乎战事最重要的问题，更别提重火力配置、军官伤亡补充等等突发事件了。
章奎最后也不得不采取抽调参谋部的人员进行协调的指挥模式，不过，也正是经过战争的检验，军官们对于立刻进行军制改革的重要性十分认同，毕竟，军队战斗力唯一的判断标准就是是否能贯彻作战目标！
而且，更重要的是，军政部下达的新编制中，可以说是为军中提供了更多的军官位置，这无疑是对各镇参战的极大奖励，经历北方战争中成长起来的这一批优秀军人，战胜了北方恶劣自然环境和深入敌境作战考验，即便是那些老兵，都是军队中不可多得的优秀苗子。
而对于这一点，秦铠自然也是心知肚明，今后二十年间，这批优秀的军人，将是构筑成整个国防体系和帮助自己挑战整个旧体制、旧体系的核心力量，太祖“枪杆子里面出政权”的明言，已经被历史一次次的证实……所谓民主，那也是法律完善、体制优秀下催生的产物。
这份出自秦铠之手的新军编制，自然是全盘照搬了后世铁军的模式，而事实上，南洋新军从一定意义上就有一些改变，设立了营级重火力部队，而新的军队编制下更是强化了这一要求，设立班、排、连、营、团、师、军的编制。
每班10人，设班长、班副，3个班为一排，3个排加上连属直辖排构成一个基本作战单位连队，人数约为120人，4个连为一营，保持现有的500人规模，这也是保持战斗力的需要，同时增设团、师编制。
标准团辖3个营1500人，而师为陆军标准建制，辖6个团加上师部军官为10000人，目前唯一的旅级编制为马龙所辖的新军第六特种旅，下辖4个团、6000人编制，不过对于这个以特种作战为发展目标的特种旅，绝对是藏龙卧虎之地。
如此一番整编之后，整个新军、除了蒙北的新八镇、东北的北方刘永福部驻漠河6个步兵营、10个骑兵营、4个炮兵营外，包括驻扎北京的新军一镇在内，一共越11万8千人将进行整编，而一旦整编完成，南洋新军将不是简单的进行了军队人数的调整，而是在现有基础上进行了一次全方位的扩编，而且不是简简单单的扩充人数。
届时，整个南洋新军将建立5个方面军，不包括东北漠河军团和蒙北军团，军队将扩编至18万人，缺额部分全部由地方预备役、士官学校和新兵补充，分别驻守东北、华东、湖广、两广、闽浙，而四川、陕甘则由湖广、京畿新军入驻。
更重要的一点是，秦铠将在这18个师、旅编制中，设立9个甲种师、9个乙种师，能否名列其中，一切都以战绩、训练来说话，而武器、装备的配置上，甲种师旅编制将明显高于乙种师旅。
例如，班级火力配置中，甲种师编制将配置ak02步枪5支和80式冲锋枪5支，配置比为1:1，而乙种师的班级编制，仅能配置到8支ak02步枪和2支80式冲锋枪，营级编制中，甲种师配置一个野炮连4门68mm野炮、6门80mm重迫击炮，而乙种师中同级规模部队的重火力配置则要低一个档次，只配置4门68mm野炮和4门60mm迫击炮、2门80mm迫击炮。
新军已经直接跨越了所谓的排枪时代，直接进入了火力时代，配置枪械火炮上的差距，对于指挥官而言，这其中的差别可谓是完全无法忍受的，更何况，这一次能够被任命为师长级别的军官，那一个不是身经百战的常胜将军，下面这些军官一听这位秦大总长安排，立刻就意识到，这个师长位置绝对是一个让人喜欢又抓狂的职位……
一旦坐上这个位置，那个师长不得玩命的训练部队，争取第一波被列入甲等师，而一旦不幸列入乙等师后，这跌了面子的师长们还不得更加发狂的拿着鞭子整天监督手下这些新兵蛋子训练，不练回甲等行列，出门都不好意思见同僚啊！