之后，小刚和小霞也相继起了床，吃完早餐之后，小智他们这次又准备去大木博士研究所的后山碰碰运气。
到了大木博士的研究所，小智拿出了他在联盟大赛前后捕获的猫老大，大尾立，利欧路，喇叭芽，飞天螳螂，椰蛋树，伊布，百变怪，索罗亚，麒麟奇，雷公，壶壶给大木博士研（贿）究（赂），大木博士见小智有这么多新的神奇宝贝，自然也是非常高兴，当看到雷公和闪光壶壶的时候，大木博士瞬间目瞪口呆，就连一旁的小刚和小霞也很诧异。
“小智，麒麟奇，索罗亚，雷公和壶壶你是什么时候捕捉到的啊？”小刚不解地问道，他可从来没见过小智收服过这四个神奇宝贝。
“今天早上在厨房里收服的。”小智****地说了一句，这句话更是把小刚，小霞和大木博士给吓到了。
“厨房！你觉得一只雷公会傻乎乎地跑到厨房里等着被你收服吗？”大木博士大声地说道，小智的话实在是违背了常理。
不过等他说完这句话，还没有等小智回答，雷公已经非常生气地朝大木博士使出了放电技能，把大木博士电了个外酥里嫩，口中吐出了一口浓浓的黑气。
“大木博士，对不起。”小智连忙说道，然后朝雷公使了个颜色，雷公立刻会意，也开始朝大木博士鞠躬道歉，“情况是这样的……（详情请见上文）。”
说罢，大木博士，小霞和小刚用一种非常的嫉妒地目光看了看小智：“三个神奇宝贝蛋里面居然一个是传说中的神奇宝贝，一个是闪光神奇宝贝，还有一个也天赋极高，小智，你有成为一个赌徒的潜质啊！”
“呵呵~~”小智哂笑了一下，然后就说道，“大木博士，你能不能看在神奇宝贝的面子上让我们三个人在你的研究所里面好好逛逛啊！”
“哦，原来你打的是这个主意啊！我想你怎么会突然间这么主动。没有问题。”大木博士瞬间了解，点了点头，说道。
听到大木博士这么说，小智，小霞和小刚自然欢呼雀跃，小霞和小刚就一下子跑到了后山，唯独小智还留在大木博士面前。
“大木博士，问你一个问题。听说许多地方都开始复活化石神奇宝贝，你有这个打算吗？”小智说道，他不知道为什么绕过了大傻谷，没有捉到古代的神奇宝贝，再加上古代神奇宝贝没有蛋，只有化石，只能通过化石复活，虽然小智拥有化石复活机，但是如果直接复活以后
就很难在大众面前使用。
“我一想啊！可是制作复活化石神奇宝贝的仪器可是需要许多的资料的，而且还需要许多的化石，条件有些苛刻啊！”大木博士叹了一口气，说道。
“大木博士，化石我有不少哦！”小智说道，然后拿出了许多的化石：螺贝化石，甲壳化石，抓部化石……各种化石应有尽有。
“小智，你怎么会有这么多的化石！”大木博士大吃一惊，说道，然后非常高兴，“这样一来我应该就可以好好做试验了。”
“大木博士，而且我曾经有幸见证了一个化石的复活，说不定我可以帮到你。”小智说道，他虽然没有把自己的那个化石复活器拆开来好好检查，但是也用超能力扫过一遍，对于大概的原理还是了解的。
“那真是太好了！小智，你就当我的临时助手吧！我们争取尽早把化石复活器制作出来！”大木博士激动地说道。
“没有问题。”小智说道，虽然创造一个化石复活器非常的困难，但是如果是仿制就简单多了。
接着，小智和大木博士忙活了起来，在接下来的一个星期里面，小智全部都在大木博士的研究所里面帮助大木博士，而小刚和小霞则先回到了尼比道馆和华兰道馆，去和挑战者对战，磨练自己。
经过了小智和大木博士的不懈努力，终于一个在理论上可以复活化石的仪器做好了，小智和大木博士迫不及待地将一个甲壳化石放入了化石复活器，等了大概半个小时，化石复活器停了下来，大木博士一下子打开了化石复活器，一只化石盔已经在化石复活器里面出现了。
大木博士兴奋极了，对小智说道：“这绝对是跨时代的重大发明啊！这样一来我们可就是领先于许多其他的地方了。”
“好了，大木博士，先把他收服了吧！”小智提醒道，如果让化石盔逃掉了就不好了。
“小智，这个化石可是你的啊！”大木博士说道，“这个化石盔也应该归你。”
“没有必要，大木博士，我不是还有许多的化石吗！下一个再轮我好了。”小智十分大方地说道，大木博士为了这个化石复活器可是费心费力，得到几只神奇宝贝也是无可厚非。
大木博士这次没有推脱，扔了一个神奇宝贝球，就直接收服了化石盔。
接着，小智和大木博士又复活了许多化石，最后，大木博士得到了菊石兽，化石翼龙，头盖龙，始祖翼龙，触手百合，太古羽虫，始祖小鸟，原盖海龟；而小智得到了两只化石盔，两只菊石兽，一只化石翼龙，两只原盖海龟，两只太古羽虫，一只触手百合。
小智把自己的古代的神奇宝贝全部放入了翡翠空间，古代神奇宝贝其实和现代神奇宝贝唯一不同之处就在于化石神奇宝贝复活之后肯定会有一个岩石系，也许是因为变成化石的缘故，也许是因为只有岩石系的神奇宝贝才拥有变成化石的资格，这个就不是小智思考的问题了。
这些神奇宝贝一进入了翡翠空间，原本因为刚刚复活的孱弱瞬间就没有了，许多等级还有所提升，化石翼龙重振了原本天空霸主的雄风；原盖海龟，菊石兽，化石盔都潜入了湖泊里面，自由自在；太古羽虫和触手百合则在草原和森林里嬉戏……