1900年4月底，又一大批英国援军开到南非。经过兵力调整，在主攻方向上，罗伯茨有八个步兵师（第3、6、7、8、9、10、11师、殖民地师）和第12骑兵师。英军在五月初重新发动进攻。5月12日，罗伯茨的大军攻克奥兰治自由邦的新首都克龙斯塔德，德韦特和博塔掩护着在牛车上办公的斯泰因总统和奥兰治政府，再度后撤到一个荒凉的小村—林德利（Lindley）。由于接连遭到失败，布尔人的士气一落千丈。在罗伯茨的宽大许诺下，许多在英军后方活动的民团团员纷纷向英国人投降，交出武器，然后返回自己的农场。到五月中旬，仍在战斗的布尔人只剩下了两万多人。
骑马进入奥兰治临时首都克隆斯塔德的罗伯茨（中右）和基钦纳（中左）
西线方面，5月17日，罗伯茨派出的一支部队在马弗京郊外击败了斯奈曼（Snyman）指挥的布尔民团，解马弗京之围，打通了连接开普和贝专纳兰的西开普铁路。固守马弗京长达210天的巴登·鲍威尔上校成了大英帝国的民族英雄，英国报纸对“英勇的马弗京保卫战”大加吹捧。5月19日，东线的布勒将军攻克了从纳塔尔通往德兰士瓦的大门，第一次布尔战争中那场决定性的战役地点——朗峡。由于一度凶狠善战的布尔野战部队已经成了强弩之末，布勒的部队在9天内竟然推进了138英里！
巴登－鲍威尔上校（1857－1941）.布尔战争后受封为男爵。在1908年创立了国际童子军运动，二战中曾经被希特勒列入一旦占领英国便立即加以逮捕的政治家名单
1900年5月24日，米尔纳勋爵在布隆方丹宣布，从即日起大英帝国兼并奥兰治自由邦，将其改为“奥兰治河殖民地”，他自己担任殖民地的第一任总督。在场的布尔人无不洒下一掬热泪。奥兰治自由邦政府虽然比暴富的德兰士瓦政府清廉、开明得多，但是狭隘的民族感情和政治上的短视使他们最终丧失了独立地位。
吞并奥兰治之后，英军加紧向德兰士瓦进攻。5月29日，弗兰奇将军指挥澳大利亚骑兵部队，在约翰内斯堡南郊的克利普河击败了守卫这座南非矿业中心的最后一支防御部队。5月30日，克鲁格总统乘坐火车离开首都比勒陀利亚，之后的三个月他一直在这列火车上指挥军队继续作战。5月31日，罗伯茨进入约翰内斯堡。
布尔战争中的澳大利亚骑兵部队
在消灭了试图抵抗英军、保卫首都的最后几支零散部队之后，1900年6月5日清晨，英军开进了空荡荡的比勒陀利亚。关押在这座城市中的英军战俘从用作监狱的国立师范学校中释放出来，和入城的英军热烈拥抱。半年之后故地重游的随军记者丘吉尔先生满意地发现，他那些留在战俘营的同胞都得到了德兰士瓦人良好的待遇。入城士兵们还举行了联欢活动，随同罗伯茨远征南非的诺福克公爵、马尔巴罗公爵同格拉斯哥的士兵一道跳起了苏格兰舞蹈。下午两点整，罗伯茨将军骑马入城。他发现这座绿荫环抱中的城市“典雅而庄重，建筑宏伟，市容整洁，完全可以和欧洲第一流国家的首都媲美”。
高举着五颜六色军旗的英军从各个方向入城，黄色卡其布的潮流在比勒陀利亚的街道上整整流淌了两个钟头。罗伯茨和他的参谋部人员沿着克鲁格总统大街来到位于城市中央的政府广场上，广场的中央是一个光秃秃的大理石基座，上面前不久还安放着克鲁格先生的铜像。广场周围环绕着古典主义风格的政府各部、立法会和南非高等法院大楼。罗伯茨抬头望去，在南非共和国立法会大厦上，已经高高地升起了米字旗。
英国国旗在比勒陀利亚的德兰士瓦立法会大厦（Raadzaal）上升起
攻占比勒陀利亚之后，罗伯茨的四万部队在原地休整。但是他不久就懊恼地发现，英军从开普敦到比勒陀利亚的漫长补给线受到了仍在抵抗的布尔人的袭击。盘踞在奥兰治东部山地和西北隅的斯泰因、博塔、德拉瑞、德韦特、普林斯洛等人仍在指挥着大约一万人的布尔部队，不断骚扰东西开普铁路，破坏英军交通线。经过几次战斗，弗兰奇将军的骑兵将他们驱逐到了巴苏陀保护国边境。布勒将军指挥纳塔尔境内的英军向西进军，于7月6日在东德兰士瓦的斯坦德顿（Standerton）同北上英军主力会师，将残存的布军分割为两部分。此时，德兰士瓦和奥兰治的主要城市和铁路线已经被全部占领，布军开始转入游击战。在约翰内斯堡和比勒陀利亚两地，英军还挫败了多起布尔人的暴动企图，罗伯茨不得不宣布，如果再有类似企图，他将停止释放战俘。
1900年9月1日，罗伯茨宣布英国兼并德兰士瓦，并宣称战争结束。9月11日，克鲁格总统得到流亡的德兰士瓦政府授权，抵达葡属莫桑比克首府洛伦索马贵斯，10月19日，克鲁格乘坐荷兰女王威廉明娜派来的巡洋舰格尔德兰号（DeGelderland）前往欧洲求援。在欧洲，虽然克鲁格受到德国人、法国人、荷兰人的狂热欢迎，但是正在忙于向中国勒索赔款和处理义和团善后事宜的欧洲各国政府，特别是在非洲问题上已同英国************的德国政府，却表现十分冷淡。威廉二世皇帝为了躲开他，干脆跑去乡下庄园狩猎。克鲁格在法国和瑞士度过了最后四年的流亡生活。
英军发动第二次大攻势之后，布尔人失利的原因是多方面的：
首先，从1900年初开始，南非的英军在数量上占绝对优势，最多时为33万人，到1900年第四季度仍维持25万人左右，为布军的5到10倍。英军数量上的压倒优势远远弥补了战斗能力上的不足。
其次，布尔民团以骑马步枪兵为主，长于骑射而不善肉搏。由于德兰士瓦和奥兰治的铁路分布不均，主要集中在德兰士瓦的工矿地带和奥兰治中部，所以布军在大片荒原战场上的机动能力主要靠骑兵奔袭，不能携带重型火炮，而且因为几十年以来布尔人的交战对手主要是非洲人土著，所以布尔人长于野战而不善攻城，包围的所有英方主要城镇无一攻破，旷日持久的围城战严重地分散了布军有限的兵力，造成英军更大的数量优势。
第三，布尔人的武装民团虽然在总司令的统一指挥下作战，但是根据布尔人的自治传统，每个民团在战斗中都有相当大的自治和自决权力。在科伦索战役中便暴露出了这个缺点。当英军转入进攻布尔共和国本土，主要战场移到布尔人家园时，向来纪律松懈的布尔民团的固有弱点更充分地暴露出来。不少民团自行解散回家，守卫自己的农场。
还有，罗伯茨和基钦纳到任之后，大力整顿南非的铁路交通，利用东西开普铁路的强大运输能力，将大规模的兵团快速运送到前线，从而使英军得以充分发挥大兵团作战长驱直入的威力。
总之，到了1900年初，布尔战争的第二时期，战争已进入了作战双方比拼国力的消耗阶段。与领土遍布全球、工业规模居世界之首、完全控制海洋且拥有上亿人口的大英帝国相比，两个布尔共和国只有四十四万人口，以采矿业为基础发展起来的工业体系，使得他们除了矿业和消费品制造之外没有大规模的工业，尤其缺少对国防极为重要的钢铁、军火和化学工业，其军火物资依靠从德国、法国和荷兰进口。而且作为内陆国家，在英国及其附庸国葡萄牙关闭了主要海港的情况下，他们无法在战时从海路获得外界援助。在这种情况下，英国作为头号帝国主义大国的雄厚国力（充沛的兵源、雄厚的财力、完整的工业体系、发达的技术水平、巨大的钢铁产量、快速的海上运输能力……）对于英军在战争中获胜起到了决定性的作用。